在复杂的架空世界中，各国在武藏的舞台上，围绕着历史再现与人类存续展开宏大战争。
来自异世界的近界民攻击城市，少年们通过特殊的“触发器”与敌人进行充满战术的攻防战。
不死的新人类“亚人”被政府视为研究对象，普通高中生永井圭发现自己竟是亚人后，展开逃亡。